Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms