Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nop56Q9D6Z1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Nop56Q9D6Z1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Nop56Q9D6Z1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Nop56Q9D6Z1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Nop56Q9D6Z1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Nop56Q9D6Z1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Nop56Q9D6Z1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Nop56Q9D6Z1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Nop56Q9D6Z1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Nop56Q9D6Z1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Nop56Q9D6Z1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Nop56Q9D6Z1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Nop56Q9D6Z1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nop56Q9D6Z1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nop56Q9D6Z1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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