Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rab11fip1Q9D620 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rab11fip1Q9D620 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rab11fip1Q9D620 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rab11fip1Q9D620 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rab11fip1Q9D620 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rab11fip1Q9D620 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rab11fip1Q9D620 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rab11fip1Q9D620 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rab11fip1Q9D620 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rab11fip1Q9D620 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab11fip1Q9D620 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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