Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt20Q9D312 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt20Q9D312 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt20Q9D312 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt20Q9D312 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt20Q9D312 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt20Q9D312 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt20Q9D312 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt20Q9D312 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms