Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trim42Q9D2H5 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim42Q9D2H5 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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