Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Susd3Q9D176 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Susd3Q9D176 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Susd3Q9D176 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Susd3Q9D176 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Susd3Q9D176 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Susd3Q9D176 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Susd3Q9D176 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Susd3Q9D176 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Susd3Q9D176 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Susd3Q9D176 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Susd3Q9D176 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Susd3Q9D176 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Susd3Q9D176 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Susd3Q9D176 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Susd3Q9D176 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Susd3Q9D176 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Susd3Q9D176 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Susd3Q9D176 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Susd3Q9D176 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Susd3Q9D176 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Susd3Q9D176 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd3Q9D176 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd3Q9D176 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd3Q9D176 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd3Q9D176 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd3Q9D176 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd3Q9D176 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd3Q9D176 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd3Q9D176 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd3Q9D176 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd3Q9D176 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd3Q9D176 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd3Q9D176 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd3Q9D176 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd3Q9D176 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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Susd3Q9D176 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Susd3Q9D176 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms