Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thumpd2Q9CZB3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms