Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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