Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXF4

Tbc1d15, TBC1 domain family member 15, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d15Q9CXF4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tbc1d15Q9CXF4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tbc1d15Q9CXF4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tbc1d15Q9CXF4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tbc1d15Q9CXF4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tbc1d15Q9CXF4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tbc1d15Q9CXF4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tbc1d15Q9CXF4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tbc1d15Q9CXF4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tbc1d15Q9CXF4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tbc1d15Q9CXF4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tbc1d15Q9CXF4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d15Q9CXF4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms