Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Xrcc3Q9CXE6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Xrcc3Q9CXE6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Xrcc3Q9CXE6 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Xrcc3Q9CXE6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Xrcc3Q9CXE6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Xrcc3Q9CXE6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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