Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms