Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpusd4Q9CWX4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms