Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx10Q9CWT3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms