Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cdca4Q9CWM2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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