Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Fcf1Q9CTH6 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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