Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pard3bQ9CSB4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pard3bQ9CSB4 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pard3bQ9CSB4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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