Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms