Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQM1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQM1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQM1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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