Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms