Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrbp1Q99PL5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rrbp1Q99PL5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rrbp1Q99PL5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rrbp1Q99PL5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rrbp1Q99PL5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rrbp1Q99PL5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrbp1Q99PL5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrbp1Q99PL5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrbp1Q99PL5 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrbp1Q99PL5 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrbp1Q99PL5 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrbp1Q99PL5 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrbp1Q99PL5 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrbp1Q99PL5 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrbp1Q99PL5 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrbp1Q99PL5 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrbp1Q99PL5 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrbp1Q99PL5 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrbp1Q99PL5 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrbp1Q99PL5 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrbp1Q99PL5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrbp1Q99PL5 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrbp1Q99PL5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrbp1Q99PL5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrbp1Q99PL5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms