Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms