Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms