Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Smim11aQ99J19 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Smim11aQ99J19 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Smim11aQ99J19 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim11aQ99J19 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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