Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc8b1Q925Q3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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