Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Afg3l1Q920A7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Afg3l1Q920A7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Afg3l1Q920A7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms