Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms