Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc39cQ8VE09 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms