Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim29Q8R2Q0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms