Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hecw1Q8K4P8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms