Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms