Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ep400Q8CHI8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms