Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms