Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP56

Pgghg, Protein-glucosylgalactosylhydroxylysine glucosidase, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgghgQ8BP56 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PgghgQ8BP56 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PgghgQ8BP56 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms