Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tspan9Q8BJU2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan9Q8BJU2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms