Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pcsk9Q80W65 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pcsk9Q80W65 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pcsk9Q80W65 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pcsk9Q80W65 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pcsk9Q80W65 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pcsk9Q80W65 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcsk9Q80W65 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pcsk9Q80W65 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pcsk9Q80W65 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pcsk9Q80W65 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pcsk9Q80W65 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcsk9Q80W65 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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