Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW5

Whrn, Whirlin, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhrnQ80VW5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WhrnQ80VW5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms