Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NischQ80TM9 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms