Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rph3alQ768S4 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rph3alQ768S4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rph3alQ768S4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rph3alQ768S4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rph3alQ768S4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rph3alQ768S4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rph3alQ768S4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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