Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SynmQ70IV5 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SynmQ70IV5 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms