Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpbp1l1Q6NZP2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms