Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23ipQ6NZC7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec23ipQ6NZC7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec23ipQ6NZC7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec23ipQ6NZC7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec23ipQ6NZC7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec23ipQ6NZC7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec23ipQ6NZC7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec23ipQ6NZC7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23ipQ6NZC7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23ipQ6NZC7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23ipQ6NZC7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23ipQ6NZC7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23ipQ6NZC7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23ipQ6NZC7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23ipQ6NZC7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23ipQ6NZC7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23ipQ6NZC7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23ipQ6NZC7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23ipQ6NZC7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23ipQ6NZC7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23ipQ6NZC7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23ipQ6NZC7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec23ipQ6NZC7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms