Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm4Q6IRU2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm4Q6IRU2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms