Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Nop58Q6DFW4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nop58Q6DFW4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms