Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6DFW0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6DFW0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6DFW0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6DFW0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6DFW0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q6DFW0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6DFW0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6DFW0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms