Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kiaa1549Q68FD9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kiaa1549Q68FD9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kiaa1549Q68FD9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kiaa1549Q68FD9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kiaa1549Q68FD9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kiaa1549Q68FD9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kiaa1549Q68FD9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kiaa1549Q68FD9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kiaa1549Q68FD9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kiaa1549Q68FD9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kiaa1549Q68FD9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kiaa1549Q68FD9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kiaa1549Q68FD9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kiaa1549Q68FD9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kiaa1549Q68FD9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kiaa1549Q68FD9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kiaa1549Q68FD9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kiaa1549Q68FD9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kiaa1549Q68FD9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kiaa1549Q68FD9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Kiaa1549Q68FD9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Kiaa1549Q68FD9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Kiaa1549Q68FD9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Kiaa1549Q68FD9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Kiaa1549Q68FD9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Kiaa1549Q68FD9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Kiaa1549Q68FD9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Kiaa1549Q68FD9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Kiaa1549Q68FD9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Kiaa1549Q68FD9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Kiaa1549Q68FD9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms