Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CltcQ68FD5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CltcQ68FD5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms