Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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