Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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AtrxQ61687 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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AtrxQ61687 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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AtrxQ61687 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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AtrxQ61687 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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AtrxQ61687 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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AtrxQ61687 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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AtrxQ61687 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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AtrxQ61687 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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AtrxQ61687 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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AtrxQ61687 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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AtrxQ61687 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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AtrxQ61687 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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AtrxQ61687 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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AtrxQ61687 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
AtrxQ61687 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrxQ61687 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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