Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms