Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SynrgQ5SV85 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SynrgQ5SV85 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms